Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HERVK_113P61574 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HERVK_113P61574 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HERVK_113P61574 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HERVK_113P61574 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HERVK_113P61574 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HERVK_113P61574 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms