Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA9P57773 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA9P57773 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA9P57773 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA9P57773 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA9P57773 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA9P57773 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA9P57773 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA9P57773 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA9P57773 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA9P57773 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA9P57773 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA9P57773 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA9P57773 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA9P57773 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA9P57773 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA9P57773 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA9P57773 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA9P57773 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA9P57773 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA9P57773 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA9P57773 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA9P57773 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA9P57773 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA9P57773 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA9P57773 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA9P57773 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA9P57773 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA9P57773 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA9P57773 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA9P57773 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA9P57773 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA9P57773 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA9P57773 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA9P57773 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA9P57773 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJA9P57773 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJA9P57773 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJA9P57773 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJA9P57773 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJA9P57773 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJA9P57773 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJA9P57773 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GJA9P57773 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJA9P57773 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJA9P57773 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJA9P57773 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJA9P57773 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GJA9P57773 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJA9P57773 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJA9P57773 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJA9P57773 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GJA9P57773 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJA9P57773 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJA9P57773 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJA9P57773 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJA9P57773 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJA9P57773 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJA9P57773 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GJA9P57773 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJA9P57773 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJA9P57773 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJA9P57773 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJA9P57773 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJA9P57773 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJA9P57773 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJA9P57773 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA9P57773 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA9P57773 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA9P57773 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA9P57773 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA9P57773 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA9P57773 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA9P57773 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA9P57773 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA9P57773 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA9P57773 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA9P57773 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA9P57773 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA9P57773 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA9P57773 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA9P57773 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA9P57773 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA9P57773 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA9P57773 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA9P57773 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA9P57773 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA9P57773 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA9P57773 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA9P57773 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA9P57773 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA9P57773 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA9P57773 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA9P57773 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA9P57773 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA9P57773 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA9P57773 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA9P57773 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA9P57773 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA9P57773 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms