Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX16P57768 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX16P57768 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX16P57768 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX16P57768 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX16P57768 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX16P57768 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX16P57768 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX16P57768 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX16P57768 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX16P57768 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX16P57768 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX16P57768 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX16P57768 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX16P57768 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX16P57768 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX16P57768 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX16P57768 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
SNX16P57768 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX16P57768 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX16P57768 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX16P57768 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX16P57768 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX16P57768 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX16P57768 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX16P57768 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX16P57768 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX16P57768 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX16P57768 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX16P57768 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX16P57768 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX16P57768 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX16P57768 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX16P57768 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX16P57768 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX16P57768 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX16P57768 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX16P57768 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX16P57768 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX16P57768 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX16P57768 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX16P57768 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX16P57768 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX16P57768 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX16P57768 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX16P57768 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX16P57768 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX16P57768 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX16P57768 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX16P57768 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX16P57768 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX16P57768 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX16P57768 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX16P57768 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX16P57768 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX16P57768 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX16P57768 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX16P57768 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX16P57768 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX16P57768 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX16P57768 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX16P57768 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX16P57768 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX16P57768 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX16P57768 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX16P57768 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX16P57768 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX16P57768 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX16P57768 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX16P57768 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX16P57768 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX16P57768 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX16P57768 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX16P57768 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX16P57768 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX16P57768 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX16P57768 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX16P57768 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX16P57768 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX16P57768 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX16P57768 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX16P57768 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX16P57768 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX16P57768 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX16P57768 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX16P57768 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX16P57768 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX16P57768 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX16P57768 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX16P57768 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX16P57768 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX16P57768 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX16P57768 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX16P57768 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX16P57768 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX16P57768 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX16P57768 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX16P57768 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX16P57768 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX16P57768 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms