Protein–RNA interactions for Protein: P56962

STX17, Syntaxin-17, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX17P56962 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STX17P56962 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
STX17P56962 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STX17P56962 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STX17P56962 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
STX17P56962 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STX17P56962 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STX17P56962 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
STX17P56962 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STX17P56962 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STX17P56962 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STX17P56962 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STX17P56962 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STX17P56962 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX17P56962 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX17P56962 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX17P56962 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX17P56962 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX17P56962 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX17P56962 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX17P56962 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX17P56962 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX17P56962 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
STX17P56962 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX17P56962 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX17P56962 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX17P56962 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX17P56962 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX17P56962 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
STX17P56962 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX17P56962 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX17P56962 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX17P56962 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX17P56962 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX17P56962 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX17P56962 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX17P56962 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX17P56962 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX17P56962 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX17P56962 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX17P56962 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX17P56962 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX17P56962 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX17P56962 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX17P56962 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX17P56962 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX17P56962 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX17P56962 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX17P56962 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX17P56962 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX17P56962 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX17P56962 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX17P56962 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX17P56962 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX17P56962 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX17P56962 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX17P56962 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX17P56962 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX17P56962 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX17P56962 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX17P56962 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX17P56962 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX17P56962 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
STX17P56962 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX17P56962 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX17P56962 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX17P56962 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX17P56962 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX17P56962 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX17P56962 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX17P56962 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX17P56962 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX17P56962 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX17P56962 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX17P56962 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX17P56962 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX17P56962 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX17P56962 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX17P56962 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX17P56962 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX17P56962 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
STX17P56962 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX17P56962 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX17P56962 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX17P56962 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX17P56962 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX17P56962 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX17P56962 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX17P56962 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX17P56962 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX17P56962 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX17P56962 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
STX17P56962 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX17P56962 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX17P56962 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX17P56962 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX17P56962 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX17P56962 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
STX17P56962 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX17P56962 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.8 ms