Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC12A2P55011 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC12A2P55011 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms