Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP12AP54707 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms