Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATN1P54259 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATN1P54259 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATN1P54259 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATN1P54259 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATN1P54259 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATN1P54259 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATN1P54259 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATN1P54259 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATN1P54259 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATN1P54259 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATN1P54259 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATN1P54259 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATN1P54259 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATN1P54259 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATN1P54259 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATN1P54259 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATN1P54259 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATN1P54259 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATN1P54259 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATN1P54259 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATN1P54259 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATN1P54259 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATN1P54259 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATN1P54259 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATN1P54259 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATN1P54259 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATN1P54259 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATN1P54259 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATN1P54259 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATN1P54259 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATN1P54259 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATN1P54259 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATN1P54259 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATN1P54259 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATN1P54259 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATN1P54259 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATN1P54259 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATN1P54259 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATN1P54259 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATN1P54259 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATN1P54259 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATN1P54259 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATN1P54259 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATN1P54259 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATN1P54259 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATN1P54259 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATN1P54259 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATN1P54259 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATN1P54259 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATN1P54259 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATN1P54259 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATN1P54259 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATN1P54259 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATN1P54259 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATN1P54259 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATN1P54259 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATN1P54259 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATN1P54259 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATN1P54259 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATN1P54259 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATN1P54259 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATN1P54259 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATN1P54259 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATN1P54259 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATN1P54259 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATN1P54259 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATN1P54259 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATN1P54259 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATN1P54259 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATN1P54259 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATN1P54259 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATN1P54259 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATN1P54259 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATN1P54259 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATN1P54259 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATN1P54259 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATN1P54259 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATN1P54259 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATN1P54259 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATN1P54259 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATN1P54259 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATN1P54259 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATN1P54259 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATN1P54259 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATN1P54259 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATN1P54259 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATN1P54259 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATN1P54259 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATN1P54259 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATN1P54259 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATN1P54259 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATN1P54259 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATN1P54259 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATN1P54259 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATN1P54259 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATN1P54259 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATN1P54259 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATN1P54259 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATN1P54259 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms