Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIRAP54198 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HIRAP54198 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIRAP54198 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIRAP54198 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIRAP54198 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIRAP54198 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIRAP54198 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIRAP54198 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIRAP54198 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIRAP54198 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIRAP54198 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIRAP54198 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIRAP54198 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIRAP54198 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIRAP54198 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIRAP54198 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIRAP54198 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIRAP54198 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIRAP54198 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIRAP54198 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIRAP54198 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIRAP54198 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIRAP54198 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIRAP54198 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HIRAP54198 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIRAP54198 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIRAP54198 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIRAP54198 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIRAP54198 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIRAP54198 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIRAP54198 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIRAP54198 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIRAP54198 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIRAP54198 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIRAP54198 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HIRAP54198 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIRAP54198 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIRAP54198 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIRAP54198 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIRAP54198 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIRAP54198 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIRAP54198 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HIRAP54198 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIRAP54198 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIRAP54198 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIRAP54198 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIRAP54198 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIRAP54198 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HIRAP54198 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIRAP54198 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIRAP54198 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIRAP54198 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIRAP54198 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIRAP54198 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIRAP54198 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HIRAP54198 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HIRAP54198 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIRAP54198 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIRAP54198 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIRAP54198 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIRAP54198 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIRAP54198 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIRAP54198 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIRAP54198 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIRAP54198 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIRAP54198 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIRAP54198 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIRAP54198 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIRAP54198 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIRAP54198 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIRAP54198 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIRAP54198 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HIRAP54198 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HIRAP54198 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIRAP54198 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIRAP54198 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIRAP54198 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIRAP54198 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIRAP54198 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIRAP54198 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIRAP54198 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIRAP54198 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIRAP54198 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIRAP54198 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIRAP54198 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIRAP54198 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIRAP54198 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIRAP54198 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIRAP54198 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIRAP54198 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIRAP54198 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIRAP54198 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIRAP54198 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIRAP54198 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIRAP54198 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIRAP54198 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIRAP54198 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIRAP54198 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIRAP54198 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms