Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACLYP53396 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACLYP53396 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACLYP53396 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACLYP53396 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ACLYP53396 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ACLYP53396 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACLYP53396 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACLYP53396 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACLYP53396 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACLYP53396 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACLYP53396 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACLYP53396 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACLYP53396 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACLYP53396 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACLYP53396 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACLYP53396 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACLYP53396 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ACLYP53396 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACLYP53396 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACLYP53396 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACLYP53396 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACLYP53396 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACLYP53396 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACLYP53396 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACLYP53396 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACLYP53396 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACLYP53396 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACLYP53396 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACLYP53396 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACLYP53396 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACLYP53396 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACLYP53396 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACLYP53396 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACLYP53396 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACLYP53396 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACLYP53396 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACLYP53396 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACLYP53396 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACLYP53396 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACLYP53396 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACLYP53396 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACLYP53396 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACLYP53396 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACLYP53396 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACLYP53396 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACLYP53396 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACLYP53396 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACLYP53396 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACLYP53396 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACLYP53396 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACLYP53396 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
ACLYP53396 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACLYP53396 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACLYP53396 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACLYP53396 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACLYP53396 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACLYP53396 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACLYP53396 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACLYP53396 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACLYP53396 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACLYP53396 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACLYP53396 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACLYP53396 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACLYP53396 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACLYP53396 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACLYP53396 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACLYP53396 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACLYP53396 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACLYP53396 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ACLYP53396 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACLYP53396 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACLYP53396 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACLYP53396 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACLYP53396 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACLYP53396 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACLYP53396 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACLYP53396 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACLYP53396 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACLYP53396 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACLYP53396 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACLYP53396 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACLYP53396 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACLYP53396 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ACLYP53396 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACLYP53396 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ACLYP53396 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACLYP53396 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACLYP53396 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACLYP53396 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACLYP53396 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACLYP53396 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACLYP53396 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACLYP53396 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACLYP53396 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACLYP53396 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACLYP53396 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACLYP53396 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACLYP53396 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACLYP53396 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms