Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2A2P52657 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms