Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DAP3P51398 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DAP3P51398 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DAP3P51398 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DAP3P51398 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DAP3P51398 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DAP3P51398 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DAP3P51398 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DAP3P51398 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DAP3P51398 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DAP3P51398 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DAP3P51398 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DAP3P51398 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DAP3P51398 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DAP3P51398 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DAP3P51398 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DAP3P51398 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DAP3P51398 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DAP3P51398 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DAP3P51398 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DAP3P51398 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DAP3P51398 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DAP3P51398 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DAP3P51398 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DAP3P51398 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DAP3P51398 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DAP3P51398 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DAP3P51398 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DAP3P51398 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DAP3P51398 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DAP3P51398 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DAP3P51398 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DAP3P51398 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DAP3P51398 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DAP3P51398 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DAP3P51398 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DAP3P51398 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DAP3P51398 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DAP3P51398 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DAP3P51398 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DAP3P51398 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DAP3P51398 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DAP3P51398 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DAP3P51398 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DAP3P51398 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DAP3P51398 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DAP3P51398 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DAP3P51398 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DAP3P51398 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DAP3P51398 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
DAP3P51398 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
DAP3P51398 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DAP3P51398 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DAP3P51398 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DAP3P51398 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DAP3P51398 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DAP3P51398 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DAP3P51398 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DAP3P51398 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DAP3P51398 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DAP3P51398 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DAP3P51398 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DAP3P51398 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DAP3P51398 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DAP3P51398 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DAP3P51398 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DAP3P51398 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DAP3P51398 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DAP3P51398 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DAP3P51398 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DAP3P51398 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
DAP3P51398 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DAP3P51398 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DAP3P51398 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
DAP3P51398 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DAP3P51398 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DAP3P51398 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DAP3P51398 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DAP3P51398 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DAP3P51398 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
DAP3P51398 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DAP3P51398 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DAP3P51398 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DAP3P51398 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DAP3P51398 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DAP3P51398 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DAP3P51398 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DAP3P51398 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DAP3P51398 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DAP3P51398 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DAP3P51398 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DAP3P51398 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DAP3P51398 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DAP3P51398 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DAP3P51398 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DAP3P51398 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DAP3P51398 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DAP3P51398 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DAP3P51398 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DAP3P51398 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms