Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GATMP50440 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATMP50440 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATMP50440 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATMP50440 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATMP50440 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATMP50440 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATMP50440 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATMP50440 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATMP50440 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATMP50440 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATMP50440 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATMP50440 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATMP50440 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATMP50440 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GATMP50440 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATMP50440 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATMP50440 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATMP50440 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATMP50440 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATMP50440 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GATMP50440 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GATMP50440 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GATMP50440 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GATMP50440 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GATMP50440 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATMP50440 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATMP50440 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATMP50440 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATMP50440 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATMP50440 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATMP50440 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATMP50440 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATMP50440 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATMP50440 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATMP50440 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GATMP50440 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATMP50440 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATMP50440 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATMP50440 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATMP50440 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATMP50440 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATMP50440 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATMP50440 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATMP50440 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATMP50440 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATMP50440 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATMP50440 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATMP50440 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATMP50440 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATMP50440 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATMP50440 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATMP50440 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATMP50440 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATMP50440 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATMP50440 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATMP50440 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATMP50440 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATMP50440 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATMP50440 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATMP50440 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATMP50440 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATMP50440 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATMP50440 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATMP50440 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATMP50440 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATMP50440 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATMP50440 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATMP50440 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATMP50440 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GATMP50440 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATMP50440 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GATMP50440 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATMP50440 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GATMP50440 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATMP50440 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATMP50440 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATMP50440 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATMP50440 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATMP50440 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATMP50440 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATMP50440 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATMP50440 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATMP50440 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATMP50440 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATMP50440 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATMP50440 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATMP50440 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATMP50440 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATMP50440 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATMP50440 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATMP50440 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATMP50440 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATMP50440 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATMP50440 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATMP50440 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATMP50440 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATMP50440 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATMP50440 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATMP50440 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms