Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRE11P49959 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRE11P49959 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRE11P49959 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRE11P49959 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRE11P49959 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRE11P49959 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MRE11P49959 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MRE11P49959 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRE11P49959 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRE11P49959 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRE11P49959 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRE11P49959 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRE11P49959 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRE11P49959 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRE11P49959 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRE11P49959 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRE11P49959 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRE11P49959 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRE11P49959 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRE11P49959 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRE11P49959 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRE11P49959 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRE11P49959 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRE11P49959 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRE11P49959 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRE11P49959 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRE11P49959 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRE11P49959 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRE11P49959 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRE11P49959 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRE11P49959 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MRE11P49959 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MRE11P49959 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MRE11P49959 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MRE11P49959 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MRE11P49959 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRE11P49959 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MRE11P49959 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRE11P49959 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRE11P49959 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRE11P49959 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRE11P49959 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRE11P49959 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MRE11P49959 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRE11P49959 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRE11P49959 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRE11P49959 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRE11P49959 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRE11P49959 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRE11P49959 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRE11P49959 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRE11P49959 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRE11P49959 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MRE11P49959 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRE11P49959 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRE11P49959 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRE11P49959 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRE11P49959 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRE11P49959 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRE11P49959 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRE11P49959 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRE11P49959 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRE11P49959 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRE11P49959 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRE11P49959 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRE11P49959 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRE11P49959 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRE11P49959 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRE11P49959 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRE11P49959 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRE11P49959 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MRE11P49959 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MRE11P49959 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRE11P49959 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRE11P49959 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRE11P49959 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRE11P49959 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRE11P49959 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRE11P49959 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRE11P49959 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRE11P49959 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRE11P49959 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRE11P49959 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRE11P49959 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRE11P49959 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRE11P49959 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MRE11P49959 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRE11P49959 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRE11P49959 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRE11P49959 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRE11P49959 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRE11P49959 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRE11P49959 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRE11P49959 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRE11P49959 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRE11P49959 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRE11P49959 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRE11P49959 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRE11P49959 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms