Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VEGFBP49765 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
VEGFBP49765 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VEGFBP49765 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms