Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXA1P49639 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA1P49639 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms