Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PIP4K2AP48426 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PIP4K2AP48426 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms