Protein–RNA interactions for Protein: P46779

RPL28, 60S ribosomal protein L28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28P46779 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RPL28P46779 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RPL28P46779 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RPL28P46779 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RPL28P46779 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RPL28P46779 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RPL28P46779 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RPL28P46779 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RPL28P46779 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RPL28P46779 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RPL28P46779 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RPL28P46779 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RPL28P46779 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RPL28P46779 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RPL28P46779 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RPL28P46779 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RPL28P46779 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RPL28P46779 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RPL28P46779 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RPL28P46779 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RPL28P46779 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RPL28P46779 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RPL28P46779 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RPL28P46779 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPL28P46779 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPL28P46779 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPL28P46779 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPL28P46779 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPL28P46779 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPL28P46779 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RPL28P46779 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPL28P46779 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPL28P46779 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPL28P46779 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPL28P46779 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPL28P46779 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RPL28P46779 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPL28P46779 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPL28P46779 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPL28P46779 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPL28P46779 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RPL28P46779 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPL28P46779 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPL28P46779 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPL28P46779 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPL28P46779 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPL28P46779 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RPL28P46779 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPL28P46779 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPL28P46779 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPL28P46779 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPL28P46779 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPL28P46779 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPL28P46779 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPL28P46779 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPL28P46779 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPL28P46779 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPL28P46779 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPL28P46779 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPL28P46779 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPL28P46779 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPL28P46779 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPL28P46779 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPL28P46779 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPL28P46779 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RPL28P46779 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPL28P46779 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPL28P46779 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPL28P46779 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPL28P46779 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPL28P46779 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPL28P46779 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPL28P46779 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPL28P46779 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPL28P46779 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPL28P46779 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPL28P46779 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RPL28P46779 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPL28P46779 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPL28P46779 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPL28P46779 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPL28P46779 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPL28P46779 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RPL28P46779 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPL28P46779 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPL28P46779 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPL28P46779 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPL28P46779 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPL28P46779 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPL28P46779 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPL28P46779 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPL28P46779 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RPL28P46779 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPL28P46779 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPL28P46779 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPL28P46779 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RPL28P46779 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPL28P46779 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPL28P46779 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPL28P46779 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms