Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATRXP46100 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATRXP46100 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATRXP46100 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATRXP46100 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATRXP46100 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATRXP46100 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATRXP46100 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATRXP46100 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATRXP46100 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATRXP46100 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATRXP46100 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATRXP46100 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATRXP46100 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATRXP46100 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATRXP46100 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATRXP46100 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATRXP46100 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATRXP46100 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATRXP46100 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATRXP46100 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATRXP46100 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATRXP46100 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATRXP46100 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATRXP46100 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATRXP46100 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATRXP46100 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATRXP46100 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATRXP46100 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATRXP46100 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATRXP46100 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATRXP46100 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATRXP46100 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATRXP46100 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATRXP46100 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATRXP46100 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATRXP46100 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATRXP46100 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATRXP46100 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATRXP46100 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATRXP46100 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATRXP46100 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATRXP46100 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATRXP46100 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATRXP46100 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATRXP46100 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATRXP46100 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATRXP46100 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATRXP46100 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
ATRXP46100 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATRXP46100 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATRXP46100 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATRXP46100 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATRXP46100 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATRXP46100 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATRXP46100 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATRXP46100 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATRXP46100 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATRXP46100 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATRXP46100 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATRXP46100 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATRXP46100 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATRXP46100 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATRXP46100 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATRXP46100 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATRXP46100 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATRXP46100 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATRXP46100 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATRXP46100 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATRXP46100 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ATRXP46100 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATRXP46100 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ATRXP46100 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATRXP46100 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATRXP46100 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATRXP46100 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATRXP46100 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATRXP46100 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATRXP46100 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATRXP46100 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATRXP46100 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ATRXP46100 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATRXP46100 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATRXP46100 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATRXP46100 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATRXP46100 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATRXP46100 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATRXP46100 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATRXP46100 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATRXP46100 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATRXP46100 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATRXP46100 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATRXP46100 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATRXP46100 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATRXP46100 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATRXP46100 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATRXP46100 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATRXP46100 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATRXP46100 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATRXP46100 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms