Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCAMP43121 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCAMP43121 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCAMP43121 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCAMP43121 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCAMP43121 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCAMP43121 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCAMP43121 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCAMP43121 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCAMP43121 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCAMP43121 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MCAMP43121 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCAMP43121 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCAMP43121 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCAMP43121 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCAMP43121 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCAMP43121 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCAMP43121 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCAMP43121 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCAMP43121 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCAMP43121 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
MCAMP43121 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCAMP43121 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCAMP43121 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCAMP43121 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCAMP43121 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MCAMP43121 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCAMP43121 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCAMP43121 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MCAMP43121 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCAMP43121 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCAMP43121 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCAMP43121 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCAMP43121 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCAMP43121 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCAMP43121 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCAMP43121 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCAMP43121 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCAMP43121 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCAMP43121 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCAMP43121 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCAMP43121 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCAMP43121 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCAMP43121 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCAMP43121 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCAMP43121 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCAMP43121 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCAMP43121 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCAMP43121 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCAMP43121 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCAMP43121 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCAMP43121 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCAMP43121 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCAMP43121 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCAMP43121 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCAMP43121 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCAMP43121 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCAMP43121 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCAMP43121 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCAMP43121 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCAMP43121 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCAMP43121 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCAMP43121 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCAMP43121 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCAMP43121 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCAMP43121 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCAMP43121 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCAMP43121 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCAMP43121 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCAMP43121 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCAMP43121 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCAMP43121 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCAMP43121 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCAMP43121 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCAMP43121 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCAMP43121 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCAMP43121 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCAMP43121 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCAMP43121 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCAMP43121 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCAMP43121 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCAMP43121 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCAMP43121 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCAMP43121 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCAMP43121 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCAMP43121 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCAMP43121 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCAMP43121 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCAMP43121 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCAMP43121 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCAMP43121 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCAMP43121 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCAMP43121 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCAMP43121 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCAMP43121 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCAMP43121 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCAMP43121 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCAMP43121 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCAMP43121 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCAMP43121 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms