Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC1A4P43007 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC1A4P43007 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.1 ms