Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GGCXP38435 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GGCXP38435 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GGCXP38435 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GGCXP38435 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GGCXP38435 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GGCXP38435 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GGCXP38435 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GGCXP38435 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GGCXP38435 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GGCXP38435 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GGCXP38435 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GGCXP38435 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GGCXP38435 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GGCXP38435 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GGCXP38435 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GGCXP38435 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GGCXP38435 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GGCXP38435 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GGCXP38435 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GGCXP38435 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GGCXP38435 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GGCXP38435 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GGCXP38435 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GGCXP38435 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GGCXP38435 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GGCXP38435 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GGCXP38435 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GGCXP38435 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GGCXP38435 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GGCXP38435 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GGCXP38435 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GGCXP38435 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GGCXP38435 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GGCXP38435 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GGCXP38435 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GGCXP38435 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GGCXP38435 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GGCXP38435 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GGCXP38435 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GGCXP38435 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GGCXP38435 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GGCXP38435 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GGCXP38435 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GGCXP38435 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GGCXP38435 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GGCXP38435 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GGCXP38435 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GGCXP38435 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GGCXP38435 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GGCXP38435 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GGCXP38435 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GGCXP38435 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GGCXP38435 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGCXP38435 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGCXP38435 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGCXP38435 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GGCXP38435 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGCXP38435 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GGCXP38435 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGCXP38435 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGCXP38435 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGCXP38435 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGCXP38435 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGCXP38435 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGCXP38435 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGCXP38435 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GGCXP38435 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GGCXP38435 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GGCXP38435 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GGCXP38435 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GGCXP38435 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GGCXP38435 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GGCXP38435 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GGCXP38435 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GGCXP38435 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GGCXP38435 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GGCXP38435 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GGCXP38435 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GGCXP38435 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GGCXP38435 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGCXP38435 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGCXP38435 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GGCXP38435 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGCXP38435 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGCXP38435 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGCXP38435 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGCXP38435 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGCXP38435 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGCXP38435 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGCXP38435 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGCXP38435 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGCXP38435 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGCXP38435 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GGCXP38435 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGCXP38435 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGCXP38435 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGCXP38435 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GGCXP38435 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGCXP38435 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms