Protein–RNA interactions for Protein: P38358

VBA2, Vacuolar basic amino acid transporter 2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VBA2P38358 CWC22YGR278W 1734 nt2.87□□□□□ -1.95
VBA2P38358 VHR2YER064C 1518 nt2.87□□□□□ -1.95
VBA2P38358 CHO2YGR157W 2610 nt2.87□□□□□ -1.95
VBA2P38358 RPA190YOR341W 4995 nt2.87□□□□□ -1.95
VBA2P38358 CDH1YGL003C 1701 nt2.86□□□□□ -1.95
VBA2P38358 GPI19YDR437W 423 nt2.86□□□□□ -1.95
VBA2P38358 YER039C-AYER039C-A 219 nt2.86□□□□□ -1.95
VBA2P38358 SUP56tL(CAA)A 82 nt2.86□□□□□ -1.95
VBA2P38358 SUP53tL(CAA)C 82 nt2.86□□□□□ -1.95
VBA2P38358 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt2.86□□□□□ -1.95
VBA2P38358 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt2.86□□□□□ -1.95
VBA2P38358 SUP54tL(CAA)G2 82 nt2.86□□□□□ -1.95
VBA2P38358 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt2.86□□□□□ -1.95
VBA2P38358 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt2.86□□□□□ -1.95
VBA2P38358 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt2.86□□□□□ -1.95
VBA2P38358 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt2.86□□□□□ -1.95
VBA2P38358 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt2.86□□□□□ -1.95
VBA2P38358 RPL30YGL030W 318 nt2.86□□□□□ -1.95
VBA2P38358 SIP18YMR175W 240 nt2.86□□□□□ -1.95
VBA2P38358 TSC3YBR058C-A 243 nt2.86□□□□□ -1.95
VBA2P38358 DIA2YOR080W 2199 nt2.85□□□□□ -1.95
VBA2P38358 RPS21BYJL136C 264 nt2.85□□□□□ -1.95
VBA2P38358 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.85□□□□□ -1.95
VBA2P38358 YJR023CYJR023C 402 nt2.85□□□□□ -1.95
VBA2P38358 HIT1YJR055W 495 nt2.85□□□□□ -1.95
VBA2P38358 AIM26YKL037W 357 nt2.85□□□□□ -1.95
VBA2P38358 KIN82YCR091W 2163 nt2.85□□□□□ -1.95
VBA2P38358 SMC2YFR031C 3513 nt2.84□□□□□ -1.95
VBA2P38358 TIF35YDR429C 825 nt2.84□□□□□ -1.95
VBA2P38358 IRC4YDR540C 540 nt2.84□□□□□ -1.95
VBA2P38358 ERG28YER044C 447 nt2.84□□□□□ -1.95
VBA2P38358 SWM2YNR004W 441 nt2.84□□□□□ -1.95
VBA2P38358 DGK1YOR311C 873 nt2.84□□□□□ -1.95
VBA2P38358 ISU1YPL135W 498 nt2.84□□□□□ -1.95
VBA2P38358 YAT2YER024W 2772 nt2.84□□□□□ -1.95
VBA2P38358 DPB11YJL090C 2295 nt2.84□□□□□ -1.96
VBA2P38358 DYN1YKR054C 12279 nt2.84□□□□□ -1.96
VBA2P38358 GIS4YML006C 2325 nt2.84□□□□□ -1.96
VBA2P38358 CHS2YBR038W 2892 nt2.83□□□□□ -1.96
VBA2P38358 MET5YJR137C 4329 nt2.83□□□□□ -1.96
VBA2P38358 GLC3YEL011W 2115 nt2.83□□□□□ -1.96
VBA2P38358 VTC4YJL012C 2166 nt2.83□□□□□ -1.96
VBA2P38358 YDR133CYDR133C 336 nt2.83□□□□□ -1.96
VBA2P38358 RPL37AYLR185W 267 nt2.83□□□□□ -1.96
VBA2P38358 SEC22YLR268W 645 nt2.83□□□□□ -1.96
VBA2P38358 BSC3YLR465C 309 nt2.83□□□□□ -1.96
VBA2P38358 YML003WYML003W 873 nt2.83□□□□□ -1.96
VBA2P38358 YNL043CYNL043C 321 nt2.83□□□□□ -1.96
VBA2P38358 PEX17YNL214W 600 nt2.83□□□□□ -1.96
VBA2P38358 RPB11YOL005C 363 nt2.83□□□□□ -1.96
VBA2P38358 RPL20BYOR312C 519 nt2.83□□□□□ -1.96
VBA2P38358 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.83□□□□□ -1.96
VBA2P38358 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.83□□□□□ -1.96
VBA2P38358 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.83□□□□□ -1.96
VBA2P38358 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.83□□□□□ -1.96
VBA2P38358 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.83□□□□□ -1.96
VBA2P38358 YCL019WYCL019W 5313 nt2.83□□□□□ -1.96
VBA2P38358 NOP4YPL043W 2058 nt2.83□□□□□ -1.96
VBA2P38358 STE6YKL209C 3873 nt2.83□□□□□ -1.96
VBA2P38358 APC11YDL008W 498 nt2.82□□□□□ -1.96
VBA2P38358 MRH1YDR033W 963 nt2.82□□□□□ -1.96
VBA2P38358 FMP32YFL046W 624 nt2.82□□□□□ -1.96
VBA2P38358 LAG1YHL003C 1236 nt2.82□□□□□ -1.96
VBA2P38358 YJR011CYJR011C 786 nt2.82□□□□□ -1.96
VBA2P38358 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt2.82□□□□□ -1.96
VBA2P38358 YPR197CYPR197C 564 nt2.82□□□□□ -1.96
VBA2P38358 FLO1YAR050W 4614 nt2.81□□□□□ -1.96
VBA2P38358 TSA2YDR453C 591 nt2.81□□□□□ -1.96
VBA2P38358 SDH7YDR511W 402 nt2.81□□□□□ -1.96
VBA2P38358 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt2.81□□□□□ -1.96
VBA2P38358 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt2.81□□□□□ -1.96
VBA2P38358 NSL1YPL233W 651 nt2.81□□□□□ -1.96
VBA2P38358 ROY1YMR258C 1662 nt2.81□□□□□ -1.96
VBA2P38358 MDM32YOR147W 1869 nt2.81□□□□□ -1.96
VBA2P38358 CSR2YPR030W 3366 nt2.81□□□□□ -1.96
VBA2P38358 SIP3YNL257C 3690 nt2.8□□□□□ -1.96
VBA2P38358 BOI1YBL085W 2943 nt2.8□□□□□ -1.96
VBA2P38358 NTO1YPR031W 2247 nt2.8□□□□□ -1.96
VBA2P38358 YTA7YGR270W 4140 nt2.8□□□□□ -1.96
VBA2P38358 DRS2YAL026C 4068 nt2.8□□□□□ -1.96
VBA2P38358 YDR090CYDR090C 933 nt2.8□□□□□ -1.96
VBA2P38358 YER107W-AYER107W-A 321 nt2.8□□□□□ -1.96
VBA2P38358 YGR025WYGR025W 303 nt2.8□□□□□ -1.96
VBA2P38358 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt2.8□□□□□ -1.96
VBA2P38358 YAR068WYAR068W 486 nt2.8□□□□□ -1.96
VBA2P38358 YLR434CYLR434C 384 nt2.8□□□□□ -1.96
VBA2P38358 YBL071CYBL071C 309 nt2.8□□□□□ -1.96
VBA2P38358 ZEO1YOL109W 342 nt2.8□□□□□ -1.96
VBA2P38358 PEP12YOR036W 867 nt2.8□□□□□ -1.96
VBA2P38358 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt2.8□□□□□ -1.96
VBA2P38358 YKL100CYKL100C 1764 nt2.79□□□□□ -1.96
VBA2P38358 PDC2YDR081C 2778 nt2.79□□□□□ -1.96
VBA2P38358 DUF1YOL087C 3351 nt2.79□□□□□ -1.96
VBA2P38358 VOA1YGR106C 798 nt2.79□□□□□ -1.96
VBA2P38358 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.79□□□□□ -1.96
VBA2P38358 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt2.79□□□□□ -1.96
VBA2P38358 PEP8YJL053W 1140 nt2.79□□□□□ -1.96
VBA2P38358 DLS1YJL065C 504 nt2.79□□□□□ -1.96
VBA2P38358 YKL111CYKL111C 336 nt2.79□□□□□ -1.96
VBA2P38358 URA10YMR271C 684 nt2.79□□□□□ -1.96
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