Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNCAP37840 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNCAP37840 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNCAP37840 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNCAP37840 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNCAP37840 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNCAP37840 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNCAP37840 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNCAP37840 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNCAP37840 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNCAP37840 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNCAP37840 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNCAP37840 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNCAP37840 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNCAP37840 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNCAP37840 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNCAP37840 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNCAP37840 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNCAP37840 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNCAP37840 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNCAP37840 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNCAP37840 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNCAP37840 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNCAP37840 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNCAP37840 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNCAP37840 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNCAP37840 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNCAP37840 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNCAP37840 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNCAP37840 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNCAP37840 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNCAP37840 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNCAP37840 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNCAP37840 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNCAP37840 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNCAP37840 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNCAP37840 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNCAP37840 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNCAP37840 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNCAP37840 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNCAP37840 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNCAP37840 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNCAP37840 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNCAP37840 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNCAP37840 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNCAP37840 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SNCAP37840 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNCAP37840 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNCAP37840 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNCAP37840 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNCAP37840 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNCAP37840 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNCAP37840 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNCAP37840 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNCAP37840 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNCAP37840 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SNCAP37840 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNCAP37840 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNCAP37840 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNCAP37840 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNCAP37840 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNCAP37840 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNCAP37840 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SNCAP37840 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNCAP37840 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNCAP37840 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNCAP37840 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNCAP37840 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNCAP37840 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNCAP37840 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNCAP37840 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNCAP37840 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNCAP37840 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNCAP37840 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNCAP37840 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNCAP37840 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNCAP37840 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNCAP37840 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNCAP37840 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SNCAP37840 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SNCAP37840 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNCAP37840 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNCAP37840 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNCAP37840 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNCAP37840 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNCAP37840 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNCAP37840 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNCAP37840 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SNCAP37840 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNCAP37840 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNCAP37840 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNCAP37840 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNCAP37840 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNCAP37840 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNCAP37840 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNCAP37840 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNCAP37840 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNCAP37840 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNCAP37840 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNCAP37840 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms