Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP62P37198 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP62P37198 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP62P37198 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP62P37198 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP62P37198 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP62P37198 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP62P37198 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP62P37198 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP62P37198 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP62P37198 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP62P37198 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP62P37198 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP62P37198 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP62P37198 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP62P37198 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP62P37198 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP62P37198 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP62P37198 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP62P37198 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP62P37198 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP62P37198 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP62P37198 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP62P37198 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP62P37198 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP62P37198 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP62P37198 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP62P37198 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP62P37198 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP62P37198 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP62P37198 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP62P37198 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP62P37198 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP62P37198 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP62P37198 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP62P37198 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP62P37198 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP62P37198 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP62P37198 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP62P37198 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP62P37198 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP62P37198 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP62P37198 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP62P37198 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP62P37198 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP62P37198 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP62P37198 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP62P37198 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP62P37198 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP62P37198 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP62P37198 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP62P37198 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP62P37198 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP62P37198 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP62P37198 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP62P37198 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP62P37198 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP62P37198 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP62P37198 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP62P37198 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP62P37198 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP62P37198 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP62P37198 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP62P37198 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP62P37198 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP62P37198 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP62P37198 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP62P37198 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP62P37198 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP62P37198 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP62P37198 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP62P37198 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP62P37198 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP62P37198 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP62P37198 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP62P37198 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP62P37198 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP62P37198 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP62P37198 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP62P37198 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP62P37198 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP62P37198 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP62P37198 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP62P37198 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP62P37198 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP62P37198 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP62P37198 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP62P37198 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP62P37198 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP62P37198 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP62P37198 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP62P37198 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP62P37198 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP62P37198 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP62P37198 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP62P37198 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP62P37198 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP62P37198 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP62P37198 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP62P37198 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms