Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LTBRP36941 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LTBRP36941 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LTBRP36941 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LTBRP36941 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LTBRP36941 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LTBRP36941 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LTBRP36941 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LTBRP36941 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LTBRP36941 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LTBRP36941 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LTBRP36941 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LTBRP36941 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LTBRP36941 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LTBRP36941 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LTBRP36941 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LTBRP36941 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LTBRP36941 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LTBRP36941 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LTBRP36941 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LTBRP36941 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LTBRP36941 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LTBRP36941 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LTBRP36941 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LTBRP36941 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LTBRP36941 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LTBRP36941 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LTBRP36941 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LTBRP36941 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LTBRP36941 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LTBRP36941 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LTBRP36941 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LTBRP36941 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LTBRP36941 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LTBRP36941 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LTBRP36941 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LTBRP36941 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LTBRP36941 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBRP36941 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBRP36941 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBRP36941 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBRP36941 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBRP36941 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBRP36941 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBRP36941 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBRP36941 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBRP36941 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBRP36941 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBRP36941 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBRP36941 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBRP36941 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBRP36941 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBRP36941 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBRP36941 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBRP36941 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBRP36941 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBRP36941 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBRP36941 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBRP36941 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBRP36941 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBRP36941 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBRP36941 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBRP36941 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBRP36941 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBRP36941 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBRP36941 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBRP36941 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBRP36941 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBRP36941 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBRP36941 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBRP36941 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBRP36941 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBRP36941 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBRP36941 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBRP36941 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBRP36941 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBRP36941 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBRP36941 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBRP36941 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBRP36941 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBRP36941 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBRP36941 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBRP36941 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBRP36941 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBRP36941 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBRP36941 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBRP36941 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBRP36941 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBRP36941 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBRP36941 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBRP36941 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBRP36941 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBRP36941 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBRP36941 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBRP36941 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBRP36941 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBRP36941 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBRP36941 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBRP36941 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBRP36941 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms