Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms