Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms