Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ARL3P36405 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ARL3P36405 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ARL3P36405 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ARL3P36405 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL3P36405 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL3P36405 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL3P36405 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL3P36405 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL3P36405 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL3P36405 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL3P36405 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL3P36405 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL3P36405 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL3P36405 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL3P36405 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL3P36405 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL3P36405 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL3P36405 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL3P36405 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL3P36405 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL3P36405 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL3P36405 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL3P36405 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL3P36405 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL3P36405 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL3P36405 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL3P36405 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL3P36405 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL3P36405 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL3P36405 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL3P36405 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL3P36405 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL3P36405 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL3P36405 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL3P36405 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL3P36405 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL3P36405 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL3P36405 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL3P36405 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL3P36405 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL3P36405 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL3P36405 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL3P36405 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL3P36405 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL3P36405 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARL3P36405 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARL3P36405 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARL3P36405 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARL3P36405 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARL3P36405 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL3P36405 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL3P36405 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL3P36405 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL3P36405 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL3P36405 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL3P36405 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL3P36405 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL3P36405 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL3P36405 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL3P36405 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL3P36405 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL3P36405 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL3P36405 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL3P36405 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL3P36405 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL3P36405 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL3P36405 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL3P36405 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL3P36405 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL3P36405 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL3P36405 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL3P36405 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL3P36405 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL3P36405 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL3P36405 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL3P36405 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL3P36405 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL3P36405 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL3P36405 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL3P36405 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL3P36405 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL3P36405 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL3P36405 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL3P36405 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL3P36405 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL3P36405 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL3P36405 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL3P36405 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL3P36405 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL3P36405 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL3P36405 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL3P36405 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL3P36405 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL3P36405 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL3P36405 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL3P36405 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL3P36405 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL3P36405 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL3P36405 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms