Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP6P35125 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP6P35125 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP6P35125 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP6P35125 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
USP6P35125 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP6P35125 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP6P35125 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP6P35125 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP6P35125 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP6P35125 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP6P35125 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP6P35125 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
USP6P35125 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
USP6P35125 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP6P35125 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP6P35125 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP6P35125 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
USP6P35125 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP6P35125 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP6P35125 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
USP6P35125 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP6P35125 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP6P35125 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP6P35125 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP6P35125 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP6P35125 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
USP6P35125 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
USP6P35125 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
USP6P35125 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP6P35125 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP6P35125 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP6P35125 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP6P35125 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP6P35125 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP6P35125 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP6P35125 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP6P35125 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP6P35125 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP6P35125 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP6P35125 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP6P35125 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP6P35125 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP6P35125 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
USP6P35125 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP6P35125 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP6P35125 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
USP6P35125 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP6P35125 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP6P35125 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP6P35125 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP6P35125 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP6P35125 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
USP6P35125 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP6P35125 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
USP6P35125 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP6P35125 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP6P35125 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP6P35125 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
USP6P35125 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP6P35125 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP6P35125 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP6P35125 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP6P35125 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP6P35125 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP6P35125 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP6P35125 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP6P35125 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP6P35125 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP6P35125 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP6P35125 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP6P35125 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP6P35125 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP6P35125 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP6P35125 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP6P35125 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP6P35125 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP6P35125 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP6P35125 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP6P35125 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP6P35125 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP6P35125 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP6P35125 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP6P35125 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP6P35125 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
USP6P35125 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP6P35125 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP6P35125 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP6P35125 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP6P35125 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP6P35125 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP6P35125 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP6P35125 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP6P35125 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP6P35125 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP6P35125 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP6P35125 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP6P35125 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP6P35125 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP6P35125 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms