Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GBP2P32456 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP2P32456 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP2P32456 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP2P32456 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP2P32456 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP2P32456 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP2P32456 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP2P32456 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP2P32456 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP2P32456 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP2P32456 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP2P32456 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP2P32456 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP2P32456 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP2P32456 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP2P32456 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP2P32456 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP2P32456 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP2P32456 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP2P32456 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP2P32456 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GBP2P32456 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP2P32456 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP2P32456 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP2P32456 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP2P32456 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP2P32456 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP2P32456 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP2P32456 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP2P32456 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP2P32456 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP2P32456 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP2P32456 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP2P32456 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP2P32456 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP2P32456 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP2P32456 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP2P32456 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP2P32456 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP2P32456 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP2P32456 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP2P32456 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP2P32456 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP2P32456 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP2P32456 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP2P32456 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP2P32456 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP2P32456 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GBP2P32456 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GBP2P32456 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GBP2P32456 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GBP2P32456 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP2P32456 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP2P32456 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP2P32456 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP2P32456 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP2P32456 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP2P32456 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP2P32456 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP2P32456 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP2P32456 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP2P32456 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP2P32456 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP2P32456 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP2P32456 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP2P32456 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP2P32456 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP2P32456 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP2P32456 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP2P32456 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP2P32456 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP2P32456 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP2P32456 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP2P32456 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP2P32456 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP2P32456 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP2P32456 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP2P32456 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP2P32456 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP2P32456 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP2P32456 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP2P32456 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP2P32456 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP2P32456 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP2P32456 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP2P32456 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP2P32456 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP2P32456 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP2P32456 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP2P32456 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP2P32456 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP2P32456 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP2P32456 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP2P32456 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP2P32456 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP2P32456 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP2P32456 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP2P32456 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP2P32456 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms