Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBP1P32455 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBP1P32455 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBP1P32455 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBP1P32455 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBP1P32455 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBP1P32455 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBP1P32455 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBP1P32455 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBP1P32455 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBP1P32455 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBP1P32455 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBP1P32455 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBP1P32455 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBP1P32455 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBP1P32455 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBP1P32455 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP1P32455 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP1P32455 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP1P32455 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP1P32455 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP1P32455 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP1P32455 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP1P32455 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP1P32455 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP1P32455 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP1P32455 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP1P32455 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP1P32455 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP1P32455 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP1P32455 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP1P32455 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP1P32455 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP1P32455 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP1P32455 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP1P32455 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP1P32455 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBP1P32455 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBP1P32455 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GBP1P32455 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBP1P32455 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBP1P32455 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBP1P32455 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBP1P32455 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBP1P32455 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBP1P32455 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBP1P32455 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBP1P32455 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBP1P32455 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBP1P32455 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBP1P32455 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBP1P32455 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBP1P32455 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBP1P32455 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBP1P32455 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBP1P32455 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBP1P32455 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBP1P32455 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBP1P32455 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBP1P32455 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GBP1P32455 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GBP1P32455 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GBP1P32455 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GBP1P32455 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GBP1P32455 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GBP1P32455 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GBP1P32455 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GBP1P32455 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GBP1P32455 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GBP1P32455 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GBP1P32455 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GBP1P32455 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GBP1P32455 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GBP1P32455 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GBP1P32455 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GBP1P32455 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GBP1P32455 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GBP1P32455 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GBP1P32455 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GBP1P32455 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GBP1P32455 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBP1P32455 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBP1P32455 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBP1P32455 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBP1P32455 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBP1P32455 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBP1P32455 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GBP1P32455 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBP1P32455 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBP1P32455 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBP1P32455 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBP1P32455 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBP1P32455 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBP1P32455 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP1P32455 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP1P32455 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP1P32455 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP1P32455 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP1P32455 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP1P32455 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms