Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HOXA7P31268 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA7P31268 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms