Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TM4SF1P30408 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TM4SF1P30408 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms