Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD40LGP29965 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms