Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERPINB3P29508 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERPINB3P29508 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERPINB3P29508 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERPINB3P29508 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERPINB3P29508 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERPINB3P29508 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERPINB3P29508 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERPINB3P29508 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERPINB3P29508 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERPINB3P29508 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERPINB3P29508 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERPINB3P29508 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERPINB3P29508 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERPINB3P29508 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERPINB3P29508 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERPINB3P29508 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SERPINB3P29508 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERPINB3P29508 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERPINB3P29508 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERPINB3P29508 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERPINB3P29508 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SERPINB3P29508 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SERPINB3P29508 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SERPINB3P29508 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SERPINB3P29508 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SERPINB3P29508 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SERPINB3P29508 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SERPINB3P29508 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SERPINB3P29508 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
SERPINB3P29508 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SERPINB3P29508 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SERPINB3P29508 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SERPINB3P29508 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERPINB3P29508 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms