Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HMGB2P26583 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HMGB2P26583 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms