Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMLP26374 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMLP26374 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMLP26374 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMLP26374 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMLP26374 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMLP26374 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMLP26374 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMLP26374 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMLP26374 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMLP26374 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMLP26374 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMLP26374 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMLP26374 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMLP26374 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMLP26374 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMLP26374 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMLP26374 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMLP26374 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMLP26374 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMLP26374 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMLP26374 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMLP26374 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMLP26374 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMLP26374 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMLP26374 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMLP26374 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMLP26374 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMLP26374 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMLP26374 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMLP26374 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMLP26374 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMLP26374 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMLP26374 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMLP26374 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMLP26374 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMLP26374 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMLP26374 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMLP26374 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMLP26374 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMLP26374 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMLP26374 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMLP26374 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMLP26374 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMLP26374 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMLP26374 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMLP26374 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMLP26374 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMLP26374 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMLP26374 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMLP26374 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMLP26374 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMLP26374 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMLP26374 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMLP26374 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMLP26374 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMLP26374 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMLP26374 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMLP26374 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMLP26374 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMLP26374 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMLP26374 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMLP26374 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMLP26374 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHMLP26374 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHMLP26374 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHMLP26374 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHMLP26374 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMLP26374 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMLP26374 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMLP26374 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMLP26374 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMLP26374 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMLP26374 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMLP26374 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMLP26374 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMLP26374 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMLP26374 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMLP26374 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMLP26374 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMLP26374 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMLP26374 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMLP26374 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMLP26374 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMLP26374 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMLP26374 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMLP26374 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMLP26374 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMLP26374 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMLP26374 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMLP26374 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMLP26374 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMLP26374 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMLP26374 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMLP26374 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMLP26374 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMLP26374 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMLP26374 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMLP26374 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMLP26374 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms