Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKCHP24723 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKCHP24723 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKCHP24723 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKCHP24723 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKCHP24723 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKCHP24723 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRKCHP24723 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKCHP24723 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKCHP24723 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKCHP24723 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKCHP24723 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKCHP24723 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKCHP24723 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKCHP24723 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKCHP24723 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKCHP24723 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKCHP24723 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKCHP24723 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKCHP24723 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKCHP24723 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKCHP24723 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKCHP24723 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKCHP24723 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKCHP24723 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKCHP24723 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKCHP24723 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKCHP24723 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKCHP24723 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKCHP24723 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRKCHP24723 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRKCHP24723 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKCHP24723 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKCHP24723 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKCHP24723 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKCHP24723 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKCHP24723 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKCHP24723 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKCHP24723 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKCHP24723 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKCHP24723 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKCHP24723 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKCHP24723 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKCHP24723 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKCHP24723 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKCHP24723 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKCHP24723 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKCHP24723 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRKCHP24723 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKCHP24723 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRKCHP24723 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKCHP24723 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKCHP24723 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKCHP24723 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKCHP24723 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKCHP24723 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKCHP24723 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRKCHP24723 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRKCHP24723 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRKCHP24723 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKCHP24723 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKCHP24723 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRKCHP24723 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRKCHP24723 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRKCHP24723 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKCHP24723 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKCHP24723 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRKCHP24723 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRKCHP24723 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PRKCHP24723 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKCHP24723 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRKCHP24723 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRKCHP24723 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKCHP24723 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKCHP24723 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKCHP24723 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKCHP24723 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKCHP24723 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKCHP24723 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKCHP24723 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKCHP24723 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKCHP24723 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKCHP24723 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKCHP24723 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKCHP24723 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKCHP24723 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKCHP24723 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKCHP24723 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKCHP24723 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKCHP24723 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKCHP24723 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKCHP24723 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKCHP24723 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKCHP24723 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKCHP24723 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKCHP24723 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKCHP24723 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKCHP24723 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKCHP24723 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKCHP24723 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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