Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDELR1P24390 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDELR1P24390 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDELR1P24390 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDELR1P24390 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KDELR1P24390 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDELR1P24390 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDELR1P24390 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDELR1P24390 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDELR1P24390 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDELR1P24390 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDELR1P24390 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDELR1P24390 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDELR1P24390 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDELR1P24390 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDELR1P24390 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDELR1P24390 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDELR1P24390 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDELR1P24390 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDELR1P24390 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KDELR1P24390 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KDELR1P24390 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
KDELR1P24390 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDELR1P24390 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDELR1P24390 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDELR1P24390 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDELR1P24390 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDELR1P24390 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDELR1P24390 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDELR1P24390 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KDELR1P24390 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KDELR1P24390 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDELR1P24390 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDELR1P24390 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDELR1P24390 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
KDELR1P24390 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KDELR1P24390 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDELR1P24390 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDELR1P24390 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KDELR1P24390 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDELR1P24390 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR1P24390 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR1P24390 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR1P24390 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR1P24390 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR1P24390 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR1P24390 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR1P24390 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR1P24390 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR1P24390 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR1P24390 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR1P24390 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR1P24390 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR1P24390 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR1P24390 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR1P24390 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR1P24390 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR1P24390 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR1P24390 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR1P24390 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR1P24390 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR1P24390 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KDELR1P24390 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KDELR1P24390 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KDELR1P24390 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KDELR1P24390 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KDELR1P24390 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KDELR1P24390 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KDELR1P24390 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KDELR1P24390 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KDELR1P24390 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KDELR1P24390 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KDELR1P24390 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KDELR1P24390 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KDELR1P24390 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KDELR1P24390 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KDELR1P24390 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KDELR1P24390 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KDELR1P24390 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KDELR1P24390 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KDELR1P24390 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KDELR1P24390 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KDELR1P24390 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KDELR1P24390 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KDELR1P24390 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KDELR1P24390 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KDELR1P24390 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KDELR1P24390 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KDELR1P24390 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KDELR1P24390 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KDELR1P24390 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KDELR1P24390 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KDELR1P24390 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KDELR1P24390 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KDELR1P24390 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KDELR1P24390 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KDELR1P24390 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KDELR1P24390 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KDELR1P24390 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KDELR1P24390 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms