Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PTPRGP23470 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
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