Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKACBP22694 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKACBP22694 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKACBP22694 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKACBP22694 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKACBP22694 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKACBP22694 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKACBP22694 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKACBP22694 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKACBP22694 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKACBP22694 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKACBP22694 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKACBP22694 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKACBP22694 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKACBP22694 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKACBP22694 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKACBP22694 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKACBP22694 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKACBP22694 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKACBP22694 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKACBP22694 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKACBP22694 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKACBP22694 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKACBP22694 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKACBP22694 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms