Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FGFR4P22455 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms