Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCP2P22307 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCP2P22307 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCP2P22307 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCP2P22307 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCP2P22307 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCP2P22307 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCP2P22307 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCP2P22307 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCP2P22307 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCP2P22307 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCP2P22307 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCP2P22307 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCP2P22307 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SCP2P22307 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCP2P22307 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCP2P22307 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCP2P22307 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCP2P22307 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCP2P22307 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCP2P22307 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCP2P22307 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCP2P22307 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCP2P22307 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCP2P22307 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SCP2P22307 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCP2P22307 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCP2P22307 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCP2P22307 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCP2P22307 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCP2P22307 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SCP2P22307 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCP2P22307 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCP2P22307 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCP2P22307 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCP2P22307 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCP2P22307 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCP2P22307 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCP2P22307 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCP2P22307 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCP2P22307 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCP2P22307 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCP2P22307 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCP2P22307 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCP2P22307 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCP2P22307 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCP2P22307 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCP2P22307 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SCP2P22307 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCP2P22307 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCP2P22307 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCP2P22307 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCP2P22307 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCP2P22307 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SCP2P22307 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCP2P22307 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCP2P22307 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCP2P22307 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCP2P22307 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SCP2P22307 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCP2P22307 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCP2P22307 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCP2P22307 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCP2P22307 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCP2P22307 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCP2P22307 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCP2P22307 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCP2P22307 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCP2P22307 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCP2P22307 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCP2P22307 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SCP2P22307 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCP2P22307 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCP2P22307 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCP2P22307 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCP2P22307 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SCP2P22307 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCP2P22307 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCP2P22307 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCP2P22307 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCP2P22307 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCP2P22307 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCP2P22307 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCP2P22307 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCP2P22307 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCP2P22307 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCP2P22307 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCP2P22307 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCP2P22307 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCP2P22307 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCP2P22307 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCP2P22307 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCP2P22307 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCP2P22307 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCP2P22307 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCP2P22307 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCP2P22307 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCP2P22307 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCP2P22307 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCP2P22307 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms