Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCP20941 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCP20941 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCP20941 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCP20941 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCP20941 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCP20941 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCP20941 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCP20941 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCP20941 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCP20941 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCP20941 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCP20941 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCP20941 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCP20941 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCP20941 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCP20941 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCP20941 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCP20941 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCP20941 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCP20941 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCP20941 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCP20941 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCP20941 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCP20941 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDCP20941 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDCP20941 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDCP20941 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDCP20941 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDCP20941 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDCP20941 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDCP20941 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDCP20941 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDCP20941 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PDCP20941 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDCP20941 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDCP20941 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDCP20941 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDCP20941 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDCP20941 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDCP20941 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDCP20941 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDCP20941 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDCP20941 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDCP20941 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDCP20941 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDCP20941 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDCP20941 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDCP20941 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDCP20941 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDCP20941 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDCP20941 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PDCP20941 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDCP20941 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDCP20941 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCP20941 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCP20941 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCP20941 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCP20941 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCP20941 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCP20941 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCP20941 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCP20941 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCP20941 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCP20941 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCP20941 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCP20941 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCP20941 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCP20941 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCP20941 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCP20941 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCP20941 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCP20941 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCP20941 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCP20941 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCP20941 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCP20941 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCP20941 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCP20941 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCP20941 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCP20941 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCP20941 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCP20941 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCP20941 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCP20941 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCP20941 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCP20941 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCP20941 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCP20941 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCP20941 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCP20941 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCP20941 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCP20941 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCP20941 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCP20941 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCP20941 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCP20941 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCP20941 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDCP20941 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDCP20941 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms