Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CXCL3P19876 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CXCL3P19876 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CXCL3P19876 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CXCL3P19876 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CXCL3P19876 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CXCL3P19876 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CXCL3P19876 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CXCL3P19876 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CXCL3P19876 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CXCL3P19876 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CXCL3P19876 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CXCL3P19876 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CXCL3P19876 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CXCL3P19876 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CXCL3P19876 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CXCL3P19876 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CXCL3P19876 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CXCL3P19876 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CXCL3P19876 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CXCL3P19876 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CXCL3P19876 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CXCL3P19876 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CXCL3P19876 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CXCL3P19876 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CXCL3P19876 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CXCL3P19876 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CXCL3P19876 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CXCL3P19876 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CXCL3P19876 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CXCL3P19876 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CXCL3P19876 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CXCL3P19876 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms