Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A1P19634 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms