Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCL3L1P16619 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.9 ms