Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGB4P16144 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms