Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VEGFAP15692 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VEGFAP15692 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms