Protein–RNA interactions for Protein: P15374

UCHL3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UCHL3P15374 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UCHL3P15374 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms